79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0001 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0001  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0011  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000297005  normal  0.027771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0045  tRNA-Met  90.62 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00121636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0006  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0056  tRNA-Met  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.764712  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAMetVIMSS1309261  tRNA-Met  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0992753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0013  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4573  tRNA-Met  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0009  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0010  tRNA-Met  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0043  tRNA-Met  88.33 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.16192 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0003  tRNA-Met  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0048  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.758644  normal  0.700534 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-1  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.526696  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAMetVIMSS1309166  tRNA-Met  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.862204  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309107  tRNA-Met  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.856151  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAMetVIMSS1309092  tRNA-Met  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0034  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.903011  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0005  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0067  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.021091  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0022  tRNA-Met  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0717385  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet02  tRNA-Met  85.94 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00802735  normal  0.195828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0076  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0875686  normal  0.0411055 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1221  tRNA-Met  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.379489  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0089  tRNA-Met  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0017  tRNA-Met  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0033  tRNA-Met  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0263488  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0042  tRNA-Met  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.309663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0029  tRNA-Met  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0039  tRNA-Met  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0041  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0045  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-1  tRNA-Met  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.596909  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0041  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0032  tRNA-Met  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0034  tRNA-Met  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.62589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0034  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0018  tRNA-Met  84.38 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-His-1  tRNA-His  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0018    84.38 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0025  tRNA-Met  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.810324  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0036  tRNA-Met  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756842  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0010  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R18  tRNA-Met  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0015  tRNA-Met  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0018  tRNA-Met  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000031299  normal  0.0565346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0051  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.584124  normal  0.75185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0013  tRNA-Met  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0043  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50689  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0041  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000311146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0061  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0038  tRNA-Met  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0040  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0666979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0019  tRNA-Met  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0035  tRNA-Met  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.906537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0039  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10538  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0036  tRNA-Met  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.784357  normal  0.0160013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0053  tRNA-Met  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307129  normal  0.0211178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0042  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00571323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t22  tRNA-Met  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>