26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_R0076 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_R0076  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0875686  normal  0.0411055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0009  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101954  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0013  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0011  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000297005  normal  0.027771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-1  tRNA-Met  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.526696  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0043  tRNA-Met  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.16192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0006  tRNA-Met  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0016  tRNA-Met  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0023  tRNA-Met  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0929841  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0023  tRNA-Met  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0027  tRNA-Met  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0021  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0004  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.425707  normal  0.204781 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0001  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0044  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0016  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00324355  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0056  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.764712  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2722  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000264941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0013  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480722  hitchhiker  0.0000885703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0045  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00121636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0045  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0051  tRNA-Met  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.584124  normal  0.75185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAMetVIMSS1309261  tRNA-Met  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0992753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0046  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00122164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0029  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4573  tRNA-Met  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>