More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0032 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0023  tRNA-Met  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.3726300000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0066  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0020  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296259 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0037  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0038  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0258342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0067  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t027  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t028  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t029  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t030  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0074  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0086  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0039  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0018  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.721782  hitchhiker  0.000298186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0022  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000117195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0019  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0036  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0763298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0021  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0023  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031593 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0086  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0087  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0085  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0077  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0631311  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0077  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0627424  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0036  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0056  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0057  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0058  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0038  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161096  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0064  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00380472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0065  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00366622  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0085  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0231321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0037  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t057  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0444035  hitchhiker  0.000266303 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t22  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00100  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0070  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.770554  normal  0.621408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1982  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00106  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0046  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0060  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0390  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1813  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>