More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0034 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_R0034  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  98.31 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  98.31 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1453  tRNA-Met  93.42 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0026  tRNA-Met  93.06 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0062  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0560501  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0569  tRNA-Met  92.21 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0068  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.516961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0057  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00956422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0075  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000125348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0087  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0077  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t53  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0088  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0066  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00171075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0059  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00352122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0079  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0080  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0081  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0082  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0080  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654019  normal  0.0862038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0082  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0195288  normal  0.0518693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0068  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00886368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0089  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0058  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00863094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0007  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0026  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  6.52648e-26  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t052  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00629284  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0019  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0324694  normal  0.0212218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0024  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet03  tRNA-Met  97.92 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.02291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>