More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_R0048 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0007  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0026  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  6.52648e-26  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0014  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0042  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0086  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0019  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0324694  normal  0.0212218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0024  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0005  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.208114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0083  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0093  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0042  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00068414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0041  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000116747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26130  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0060  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  93.51 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  93.51 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0019  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0030  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.299355 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0070  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.770554  normal  0.621408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0046  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0056  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.029437 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>