More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_R0036 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  95.83 
 
 		 74 bp  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  95.83 
 
 		 74 bp  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  95.83 
 
 		 74 bp  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0057  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00956422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0059  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00352122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0058  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00863094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3126t  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.355044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0068  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00886368  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0082  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0195288  normal  0.0518693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0075  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000125348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t052  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00629284  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t53  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0088  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0022  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0080  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654019  normal  0.0862038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0087  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t054  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636739  hitchhiker  0.000266303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0019  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00100  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0079  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0080  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0081  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0082  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0067  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00910637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0068  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.516961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0018  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.721782  hitchhiker  0.000298186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0021  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0020  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0066  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00171075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0023  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t055  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00625421  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0089  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t056  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0248114  hitchhiker  0.000277414 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0077  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852479  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0037  tRNA-Met  95.31 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  95.24 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0023  tRNA-Met  93.24 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.3726300000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0038  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0258342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0037  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0039  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>