More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_52320 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0080  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654019  normal  0.0862038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0082  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0195288  normal  0.0518693 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0045  tRNA-Met  98.59 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0023  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0021  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0020  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t029  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t030  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t53  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0022  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0019  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0018  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.721782  hitchhiker  0.000298186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0038  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0258342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0068  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.516961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  97.18 
 
 		 77 bp  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  97.18 
 
 		 77 bp  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  97.18 
 
 		 77 bp  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t20  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t21  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.929241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t22  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0087  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00106  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0075  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000125348  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0037  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0036  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0086  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0066  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2749  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000330212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0079  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0080  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0081  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0082  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0077  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852479  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3126t  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.355044  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0033  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0177  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.202779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0087  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0088  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0085  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0089  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0067  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0038  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161096  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0066  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00171075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0067  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00910637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0068  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00886368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0059  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00352122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0058  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00863094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0057  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00956422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>