More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3199t on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3126t  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.355044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0057  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00956422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0059  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00352122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0058  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00863094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0033  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0177  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.202779  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t054  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636739  hitchhiker  0.000266303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0055  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.867908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0077  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0088  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0054  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.871356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0087  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t53  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t055  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00625421  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  97.3 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0075  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000125348  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0056  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.880459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0067  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00910637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0068  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00886368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0080  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654019  normal  0.0862038 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0079  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0080  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0081  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0082  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t056  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0248114  hitchhiker  0.000277414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0082  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0195288  normal  0.0518693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0053  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0052  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.902877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0057  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.88568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0068  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.516961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0089  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0066  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00171075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00100  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1572  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1607  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.836309 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t052  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00629284  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0019  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0020  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>