More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Met-4 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  97.3 
 
 
77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  97.3 
 
 
77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  97.3 
 
 
77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  97.3 
 
 
77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  97.3 
 
 
77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  97.18 
 
 
74 bp  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00100  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  97.3 
 
 
76 bp  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  97.3 
 
 
76 bp  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  97.3 
 
 
76 bp  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0058  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00863094  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0059  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00352122  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t21  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.929241  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t22  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0039  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.390156  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t027  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t028  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t029  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t030  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3126t  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.355044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0037  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0038  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161096  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00106  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0081  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.681899  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0054  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.965262  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0068  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.347514  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0076  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00786304  normal  0.218816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0007  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0188037  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0066  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  95.95 
 
 
76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0067  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0076  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0077  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0074  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00110  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0076  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000117195  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0033  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0177  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.202779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0056  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0057  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0058  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0086  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253829  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0086  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325929  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0085  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0231321  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0038  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0258342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0064  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00380472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0065  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00366622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0087  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>