More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0037 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0021  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.790963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0145  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000566193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0125  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166673  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0034  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0117  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.214909  hitchhiker  0.0000036975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0091  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136537  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0067  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0023  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.216301  normal  0.182837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0049  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19050  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna067  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000491703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  95.31 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  95.31 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna116  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna069  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0077  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  93.06 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0019  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna065  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000339625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna073  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000472118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna063  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03399  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00108  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3184  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00104  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  93.06 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0020  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  93.06 
 
 		 80 bp  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0040  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251493  hitchhiker  0.0001025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0041  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000296842  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0042  tRNA-Met  94.44 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00068414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0039  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00627079  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2747  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2750  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  95.31 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  95.31 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  93.06 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  95.31 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  95.31 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  93.06 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19530  tRNA-Met  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>