More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_R0039 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0087  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0085  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0086  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0067  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0066  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0037  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0036  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0038  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161096  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0034  tRNA-Met  98.31 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t20  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t21  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.929241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t22  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00110  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00106  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0086  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0039  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0036  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0763298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t027  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t028  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t029  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t030  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t53  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0038  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0258342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0037  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0068  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.516961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0046  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0076  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000117195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0074  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6011  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.991195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0043  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.343772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0076  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0077  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0076  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0631311  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0077  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0627424  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0085  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0231321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0056  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0057  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0058  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0064  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00380472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0065  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00366622  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t057  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0444035  hitchhiker  0.000266303 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00100  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  92.21 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0023  tRNA-Met  92.21 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.3726300000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0019  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306016 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.390156  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3285  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0018  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.721782  hitchhiker  0.000298186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0021  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0079  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0080  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0081  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0082  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0058  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00863094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0066  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00171075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>