More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_R0087 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_R0067  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0066  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0087  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0086  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0085  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0038  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161096  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t20  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t21  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.929241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t22  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00106  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00110  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0076  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000117195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t027  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t028  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t53  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0085  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0231321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0086  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0068  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.516961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0076  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0077  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0076  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0631311  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0077  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0627424  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0036  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0763298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0037  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0074  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0056  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0057  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0058  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0039  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0064  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00380472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0065  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00366622  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t057  tRNA-Met  98.68 
 
 		 77 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0444035  hitchhiker  0.000266303 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00100  tRNA-Met  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00051  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0089  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3280  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3281  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3282  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3283  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3284  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3285  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0077  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0079  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0080  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0081  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0082  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0057  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00956422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2956  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.211186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0087  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0068  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00886368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3183  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3661  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.677335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3185  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0059  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00352122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0088  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0075  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000125348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0058  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00863094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0066  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00171075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>