More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0014 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0007  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0026  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  6.52648e-26  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0014  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0042  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0086  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0093  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0019  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0324694  normal  0.0212218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0024  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0041  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000116747 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0030  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.299355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0046  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1982  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0070  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.770554  normal  0.621408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0019  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0056  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.029437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0060  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0390  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1813  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0083  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0042  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00068414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0005  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.208114  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0054  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0068  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0078  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000322634  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0030  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1603  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0560  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0006  tRNA-Met  94.37 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26130  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0089  tRNA-Met  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014219  hitchhiker  0.00718403 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2747  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2750  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>