31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_R0009 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_R0009  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0076  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0875686  normal  0.0411055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0013  tRNA-Met  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-1  tRNA-Met  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.526696  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0001  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0044  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0021  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0004  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.425707  normal  0.204781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0016  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00324355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0011  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000297005  normal  0.027771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0043  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.16192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0006  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4573  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0048  tRNA-Phe  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0056  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.764712  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14007  tRNA-Met  85.07 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0236309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0051  tRNA-Met  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.584124  normal  0.75185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0003  tRNA-Met  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0045  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00121636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0032  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0045  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0056  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0504799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0008  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0032  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0088  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0089  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0080  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755627  normal  0.408373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0079  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520494  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0012  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>