299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0023 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506131  normal  0.313927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0025  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0024  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0028  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0027  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0041  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00225081  hitchhiker  0.00893878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00820  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14880  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.67591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0038  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  96 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  96 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0006  tRNA-Gly  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0048  tRNA-Gly  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.950011  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0031  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.495434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11980  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000114191  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11950  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000172827  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0026  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390133  normal  0.0221224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0064  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173961  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0030  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0028  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000469989  normal  0.0212427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0612672  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0039  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0019  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000618512  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0046  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0004  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0078  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0012  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000030086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0006  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0012  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0049  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0112  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0030  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10770  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.029864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0012  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46554  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1578  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1613  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0026  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0170  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0085  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000120136  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0059  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>