298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0056 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0033  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.688616  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0006  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0026  tRNA-Gly  94.03 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390133  normal  0.0221224 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0028  tRNA-Gly  94.03 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000469989  normal  0.0212427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly01  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.682857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0036  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0034  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0050  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0043  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0285317  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0021  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0839387  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0012  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46554  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0055  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.835398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11950  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000172827  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0006  tRNA-Gly  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000670589  normal  0.608185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0007  tRNA-Gly  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264887  normal  0.61678 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11980  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000114191  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0039  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169853  normal  0.361721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0048  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.950011  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0006  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0031  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.495434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly02  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 79 bp  75.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0035  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna120  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000327902  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna002  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.41351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0037  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0035  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna122  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0036  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna068  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000044405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051021  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0495451  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0051  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000327476  normal  0.339785 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna070  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000373745  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna071  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000039316  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna072  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000043507  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0037  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0038  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0068  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00512241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2881  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2882  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0037  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0043  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00341468  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0044  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.013329  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0045  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960605  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1741  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0350949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1742  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0559851  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0036  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.19079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna066  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000517359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0039  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00658177  decreased coverage  0.00000286482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0040  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00614875  decreased coverage  0.00000263085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0019  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0020  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0021  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0035  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000173498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0036  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000574217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0037  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000566615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0036  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0050  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00077941  normal  0.344918 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0035  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0033  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0034  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205379  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0035  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2454  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.880044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2826  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0217259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2827  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2766  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0786611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2767  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0513521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2826  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2827  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1777  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00314954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna062  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000476965  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna064  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000528152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0837  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.9888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0839  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.75762e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2744  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000172539  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2745  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159921  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2746  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2748  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000195366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0049  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00162631  normal  0.347035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA4  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489059 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0010  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.695097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0011  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.770603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0009  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0063  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.362704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0023  tRNA-Gly  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506131  normal  0.313927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0039  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0058  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t35  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t61  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.58231  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA59  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609929  normal  0.691703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>