298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0033 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0033  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.688616  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0006  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0055  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.835398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04003  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000136534  normal  0.315468 
 
 
-
 
NC_003295  RS04004  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000202158  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0039  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0008  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.521069  normal  0.137143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0011  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0037  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.694382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0035  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0036  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly03  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.122122  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0007  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38046  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0037  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0010  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0183648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0044  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0908576 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0050  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15490  tRNA-Gly  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15520  tRNA-Gly  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0036  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly01  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.682857  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00080  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000419569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00081  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000257411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00082  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000239785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0084  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  6.413230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0085  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.68672e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t32  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t35  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t61  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.58231  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0072  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000137146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t21  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t23  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA45  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000360899  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA57  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256598  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA59  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609929  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4671  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.05705e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4280  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000230122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4279  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.4241200000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4278  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.821950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4953  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000153884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0039  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169853  normal  0.361721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0050  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0049  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000555538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R50  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R61  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R63  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R65  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0100  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000550184  hitchhiker  0.000011037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0098  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000512871  hitchhiker  0.000011037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0080  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.8513  normal  0.517696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0048  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0352694  hitchhiker  0.000658137 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0050  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4636  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000617917  normal  0.102645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0024  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000696404  hitchhiker  0.000000493359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0045  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0047  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.686497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4723  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.032e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0055  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00145932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0992  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.34498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4954  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000153884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0706  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0583224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0077  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707613  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0045  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0042  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0707  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0600854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0078  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67777  normal  0.517696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0039  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0048  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000507488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2338  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00378756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2337  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0125428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2616  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.256373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4724  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.56815e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5110  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5109  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0022  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631988  hitchhiker  0.000000512691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5111  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000015095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0023  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631988  hitchhiker  0.000000537949 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0049  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4238  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.1159899999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1272  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000331558  hitchhiker  0.00050925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0099  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000502602  hitchhiker  0.0000112339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4635  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000555616  normal  0.101529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0024  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4634  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000734065  normal  0.104164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0027  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.307815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0012  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000103528  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0013  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000958382  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0014  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000460398  unclonable  0.00000183303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0051  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000228053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0029  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432235  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0031  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.623556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0045  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.0236363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>