298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_t07693 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0006  tRNA-Gly  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0033  tRNA-Gly  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.688616  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0055  tRNA-Gly  91.78 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.835398  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0050  tRNA-Gly  91.78 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11950  tRNA-Gly  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000172827  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11980  tRNA-Gly  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000114191  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0043  tRNA-Gly  94.44 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0285317  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0021  tRNA-Gly  94.44 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0839387  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  94.44 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0016  tRNA-Gly  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.867595  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  94.44 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  94.44 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  94.44 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0012  tRNA-Gly  94.44 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46554  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  92.98 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0006  tRNA-Gly  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0065  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.109951  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0048  tRNA-Gly  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.950011  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  94.55 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10770  tRNA-Gly  94.55 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.029864  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0007  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264887  normal  0.61678 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0006  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000670589  normal  0.608185 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0042  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443767  normal  0.830121 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  90.32 
 
 
78 bp  75.8  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0042  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177024  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0044  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0345012  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0043  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0822724  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  91.38 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  91.38 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna21  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna23  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0023  tRNA-Gly  91.38 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506131  normal  0.313927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0041  tRNA-Gly  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142382  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0007  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38046  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0011  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189019  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.88 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.88 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04003  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000136534  normal  0.315468 
 
 
-
 
NC_003295  RS04004  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000202158  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0036  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0045  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0047  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.686497  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly01  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.682857  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0032  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0034  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  93.88 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  93.88 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0010  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0183648  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0034  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0036  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0008  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.521069  normal  0.137143 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0039  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0037  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0670203 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0037  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.694382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0035  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  92.31 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0028  tRNA-Gly  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000469989  normal  0.0212427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0026  tRNA-Gly  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390133  normal  0.0221224 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15520  tRNA-Gly  92.31 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15490  tRNA-Gly  92.31 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0045  tRNA-Gly  92.16 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.356708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0036  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0037  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0038  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0068  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00512241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2881  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2882  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0039  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00658177  decreased coverage  0.00000286482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0040  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00614875  decreased coverage  0.00000263085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0019  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0020  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0021  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0035  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2826  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2827  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0037  tRNA-Gly  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>