More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0028 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390133  normal  0.0221224 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000469989  normal  0.0212427 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11980  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000114191  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11950  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000172827  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0050  tRNA-Gly  98.21 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  94.03 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA4  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489059 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0006  tRNA-Gly  98 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000670589  normal  0.608185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0007  tRNA-Gly  98 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264887  normal  0.61678 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0010  tRNA-Gly  96 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.695097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0034  tRNA-Gly  96 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly01  tRNA-Gly  96 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.682857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0036  tRNA-Gly  96 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0011  tRNA-Gly  96 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.770603  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00080  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000419569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00081  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000257411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0085  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.68672e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t32  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t35  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t61  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.58231  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4723  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.032e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0075  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000219757  hitchhiker  0.00000000043748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0027  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0024  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4280  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000230122  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4671  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.05705e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t21  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t23  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t38  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0044  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0908576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0049  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000555538  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0072  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000137146  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0050  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0045  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA59  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609929  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R50  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R61  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R63  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R65  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2055  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000108601  hitchhiker  0.000600208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0042  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0048  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000507488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5039  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000010276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4725  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.64891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5109  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4724  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.56815e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly03  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.122122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27610  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0782148  hitchhiker  0.00257917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27620  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0363861  decreased coverage  0.00144796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30680  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00819815  hitchhiker  0.00300406 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4238  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.1159899999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4635  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000555616  normal  0.101529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2616  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.256373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0024  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0706  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0583224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0025  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0028  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0012  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000103528  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0013  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000958382  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0014  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000460398  unclonable  0.00000183303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0051  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000228053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0029  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432235  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0031  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.623556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0045  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.0236363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0992  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.34498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0027  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.307815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4279  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.4241200000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4278  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.821950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0048  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0352694  hitchhiker  0.000658137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0077  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707613  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0078  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67777  normal  0.517696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0080  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.8513  normal  0.517696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2338  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00378756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2337  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0125428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>