279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0017 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0017  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0021  tRNA-Lys  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.590249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1740  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000195232  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1159  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00817657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1737  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000166556  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1162  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0178248  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0515  tRNA-Lys  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.317798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0512  tRNA-Lys  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.299148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0509  tRNA-Lys  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226586  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0600  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212057  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0597  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1588  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0980285  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0030  tRNA-Lys  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0035  tRNA-Lys  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221382  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2262  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.11111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2216  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0052  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000609044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0052  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0040  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.17215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3177t  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07679  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.342571  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07677  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204816  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0032  tRNA-Lys  86.15 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0009  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0189312  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0847408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0008  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000700916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0028  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0127265  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0031  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0843462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna6  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.349793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna28  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.751931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0053  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000146431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0054  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000247004  normal  0.542082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0084  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0055  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000052082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0050  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0038  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000589409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t055  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t056  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t062  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0085  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0081  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0055  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000238115  normal  0.540083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0051  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000189133  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0034  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0033  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000129521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0039  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000604757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0080  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000136157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0083  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000154707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0047  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000310964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0046  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000070452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0032  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000864577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0037  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000625887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0053  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000170712  normal  0.532775 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0030  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000178627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0056  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000234634  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0052  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421031  normal  0.358949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0035  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000579305  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0035  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000175048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0032  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000114848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0031  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000137565  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0034  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000104343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0049  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000179433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0050  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000934403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0051  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000803834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0052  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0053  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0086  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000000910147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0108  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.368852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0109  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0110  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000275049  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0111  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000310231  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0112  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  normal  0.38206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0113  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000217944  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0048  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000292562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0052  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000174951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0082  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0104  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000434862  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0105  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121754  normal  0.0191559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0106  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745947  normal  0.0185833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0107  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000134786  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0108  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  0.0180264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>