245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_t07679 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_t07677  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204816  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07679  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.342571  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0031  tRNA-Lys  98.08 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0843462 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0028  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0127265  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1588  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0980285  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0043  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0044  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R10  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0017  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0597  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0600  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212057  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt42  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0006  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0007  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0009  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0021  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.590249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1162  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0178248  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0512  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.299148  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0044  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0369335 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0509  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0515  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.317798  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1159  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00817657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1737  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000166556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1740  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000195232  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0049  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4987  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000645959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0173  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0567172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0275  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5046  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0021  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160361  normal  0.0210498 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0016  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000293232  hitchhiker  0.00358578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0297  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0781  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66086e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0009  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0189312  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1581  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1616  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.620085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5728  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000897911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0060  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0073  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0028  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>