53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0600 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0600  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212057  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0597  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1588  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 78 bp  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0980285  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1740  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000195232  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.590249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1737  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000166556  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1162  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0178248  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1159  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00817657  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0512  tRNA-Lys  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.299148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0515  tRNA-Lys  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.317798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0509  tRNA-Lys  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226586  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2262  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.11111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2216  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0017  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0021  tRNA-Lys  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0035  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0030  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0009  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0189312  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0008  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000700916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07677  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204816  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07679  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.342571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  86.15 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  86.15 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  86.15 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  86.15 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  86.15 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  86.15 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  86.15 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0031  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0843462 
 
 
-
 
NC_002950  PGt42  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0053  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000411683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0040  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.17215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0012  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0028  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0127265  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0019  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00557202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0047  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000113586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0066  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00163637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0016  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0033  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0059  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0077  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3177t  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0001  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.46268e-24  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>