More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_R0065 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0053  tRNA-Lys  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0001  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.46268e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  97.92 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0017  tRNA-Lys  89.19 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.674136 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0012  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0022  tRNA-Lys  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0051  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0093  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.8722200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0001  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000658326  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0036  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0084  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00872406  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2216  tRNA-Lys  88.71 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2262  tRNA-Lys  88.71 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.11111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0021  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0068  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2517  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00884396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2527  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2528  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0071  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0090  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2221  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2231  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243187  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2232  tRNA-Lys  97.22 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210068  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0408  tRNA-Asn  90.2 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000233964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0008  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0012  tRNA-Asn  93.02 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0042  tRNA-Lys  92.16 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4329  tRNA-Lys  92.16 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  97.14 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0014  tRNA-Asn  93.02 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  90.2 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0028  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0043  tRNA-Lys  92.16 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0503955 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0452  tRNA-Asn  93.02 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.133298 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1563  tRNA-Asn  93.02 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1796  tRNA-Asn  93.02 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  6.3013000000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1802  tRNA-Asn  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000154266 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0407  tRNA-Asn  90.2 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000764097  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07711  tRNA-Met  89.66 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0043  tRNA-Lys  97.06 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0003  tRNA-Lys  88.89 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000250623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0048  tRNA-Lys  97.06 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0031  tRNA-Lys  97.06 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  85.14 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0043  tRNA-Lys  97.06 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0043  tRNA-Lys  97.06 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  85.14 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0028  tRNA-Lys  92.86 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  86.49 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0011  tRNA-Lys  97.06 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0600  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212057  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0597  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  94.44 
 
 
73 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna33  tRNA-Asn  90.38 
 
 
77 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0719  tRNA-Lys  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0071  tRNA-Asn  90.38 
 
 
77 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0038  tRNA-Asn  90.38 
 
 
77 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0746306  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0043  tRNA-Asn  90.38 
 
 
77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0029  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0040  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2619  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0471247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2626  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2305  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2312  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0043  tRNA-Asn  90.38 
 
 
77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>