46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0040 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0040  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.17215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0017  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0021  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0545  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00940655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000411683  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07679  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.342571  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07677  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0040  tRNA-Val  86.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00170097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0515  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.317798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0512  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.299148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0509  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226586  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1588  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0980285  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1162  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0178248  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1159  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00817657  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.590249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0597  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0600  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212057  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1737  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000166556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1740  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000195232  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0084  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0001  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0487853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0016  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000166672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0056  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0068  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0011  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00974618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0847408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0070  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.213378  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0031  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000744729  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2262  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.11111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2216  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0017  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1396  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0922112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>