88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0040 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00170097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0004  tRNA-Val  89.66 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0005  tRNA-Val  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0005  tRNA-Val  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0005  tRNA-Val  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.826199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0052  tRNA-Val  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137415  normal  0.324257 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0019  tRNA-Val  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt21  tRNA-Val  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  89.66 
 
 		 367 bp  60  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-1  tRNA-Val  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00200335  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt21  tRNA-Val  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  89.66 
 
 		 378 bp  60  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0053  tRNA-Val  84.93 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000170226  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0031  tRNA-Val  97.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000744729  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0506  tRNA-Val  97.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000210489  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0021  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0415147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0100  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0050  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0048  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0049  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.443386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0050  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293545  normal  0.0134461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0050  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1639  tRNA-Val  97.14 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.42917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0027  tRNA-Val  97.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00584836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0015  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0394069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0016  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0267125  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0033  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.166955 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0011  tRNA-Val  97.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0043  tRNA-Val  97.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000280883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0058  tRNA-Val  89.09 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0036  tRNA-Val  97.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000106131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0015  tRNA-Val  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0605809  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0040  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.17215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10340  tRNA-Val  83.56 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0379292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0035  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55919  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0048  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000458542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0027  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0032  tRNA-Val  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000419269  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0027  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0046  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000479411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0029  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000448285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0032  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.69442e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R10  tRNA-Val  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0022  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0042  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0013  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.557667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0013  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.459697  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0022  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0032  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0382858 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3351  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0607256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0036  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429203  normal  0.313017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0044  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0100  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682719 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000364961  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02886  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.96324  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0039  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.654664  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2123  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2476  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0055  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100813  normal  0.0566569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0051  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0408927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0017  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0037  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599971  normal  0.116724 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1953  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0014  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.20827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2318  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0283125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2359  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1228  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0045  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000428882  hitchhiker  0.00000000692947 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.752155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0047  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0721509  normal  0.0848173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0049  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0385641  normal  0.0854931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0051  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114614  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0053  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113148  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0039  tRNA-Val  83.78 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0041  tRNA-Val  83.78 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0016  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4583  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0571835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0051  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0052  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0052  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0029  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0050  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>