99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0030 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000364961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0016  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0065  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0062  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.588176  normal  0.0646028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0043  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0048  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0030  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0050  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0045  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.356708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0052  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0063  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0066  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0052  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0026  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0028  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30863e-30 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0051  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0028  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.500637 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0025  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.89126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0024  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.664304  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.850399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1650  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0921  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0039  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.022052  normal  0.0225653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0017  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000137246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0013  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0041  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000519668  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495704  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0012  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000602687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0806  hypothetical protein  96.55 
 
 		 108 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000935428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0009  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000199446  normal  0.87079 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 67 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0049  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00351411  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0017  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000592681  hitchhiker  0.00000010486 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0016  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.867595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0017  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0026  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.672407  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.433481  normal  0.466553 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0855  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0051  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0033  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0406258  normal  0.16961 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309145  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309187  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309120  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.15103  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309069  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0044  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000151844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0675454  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0035  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0213758  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0254902  normal  0.171485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0069  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.494624  hitchhiker  0.00109102 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0241  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.098729  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000029648 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0031  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00170097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0002  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.231907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0046  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000231748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309363  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0048  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000268025  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0002  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309288  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0313014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0050  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000555856  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0100  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0036  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0020  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>