298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0016 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0016  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.867595  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0042  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0041  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0043  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0822724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0044  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0345012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna21  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna23  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0032  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0039  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04003  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000136534  normal  0.315468 
 
 
-
 
NC_003295  RS04004  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000202158  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0011  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0008  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.521069  normal  0.137143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0007  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38046  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0045  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0047  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.686497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0010  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0041  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297349  decreased coverage  0.00434413 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0061  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.677288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0010  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0183648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0037  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.694382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0035  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0036  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0034  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0037  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670203 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00080  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000419569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00081  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000257411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00082  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000239785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0084  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  6.413230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0085  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.68672e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0027  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.307815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0992  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.34498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4953  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000153884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.611211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0055  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00145932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t21  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t23  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t38  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4671  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.05705e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA45  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000360899  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA57  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256598  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA59  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609929  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4634  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000734065  normal  0.104164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0026  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1272  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000331558  hitchhiker  0.00050925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0021  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0839387  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0072  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000137146  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5039  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000010276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R63  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R65  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0024  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.664304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0025  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.89126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1650  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t34  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.417453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0028  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.500637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0023  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631988  hitchhiker  0.000000537949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5110  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0045  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0098  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000512871  hitchhiker  0.000011037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0049  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0013  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0048  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000507488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4635  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000555616  normal  0.101529 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0100  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000550184  hitchhiker  0.000011037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0024  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4636  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000617917  normal  0.102645 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0099  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000502602  hitchhiker  0.0000112339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0075  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000219757  hitchhiker  0.00000000043748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4278  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.821950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0048  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0352694  hitchhiker  0.000658137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4238  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.1159899999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2616  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.256373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4280  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000230122  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0921  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0029  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432235  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0048  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4724  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.56815e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4723  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.032e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0048  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.950011  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4725  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.64891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0031  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.623556 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0051  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000228053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5109  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0022  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631988  hitchhiker  0.000000512691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5111  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000015095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0014  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000460398  unclonable  0.00000183303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0013  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000958382  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0706  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0583224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0024  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000696404  hitchhiker  0.000000493359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0042  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0050  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0049  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000555538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2055  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000108601  hitchhiker  0.000600208 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0707  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0600854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0012  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000103528  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>