262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_R0013 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_R0012  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000602687  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0013  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0017  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000137246  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0009  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000199446  normal  0.87079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0041  tRNA-Gly  98.61 
 
 
72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0049  tRNA-Gly  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0009  tRNA-Gly  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886976  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0029  tRNA-Gly  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.707259  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0014  tRNA-Gly  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000685902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0037  tRNA-Gly  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000929008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0052  tRNA-Gly  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0001  tRNA-Gly  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0054  tRNA-Gly  94.34 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0027  tRNA-Gly  88.89 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133114  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  92.73 
 
 
72 bp  77.8  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0066  tRNA-Gly  90 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000558399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0055  tRNA-Gly  87.5 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  87.5 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  87.5 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  87.5 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  92.16 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  92.16 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  92.16 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  92.16 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  92.16 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  92.16 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  92.16 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  92.16 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  92.16 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  92.16 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0026  tRNA-Gly  90.57 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.672407  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0035  tRNA-Gly  89.47 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0044  tRNA-Gly  90.57 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  87.67 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0029  tRNA-Gly  89.47 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309069  tRNA-Gly  90.57 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309120  tRNA-Gly  90.57 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.15103  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309187  tRNA-Gly  90.57 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309145  tRNA-Gly  90.57 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.11 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  90 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  86.11 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0016  tRNA-Gly  86.11 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  86.11 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  86.11 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1650  tRNA-Gly  86.11 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  86.11 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0921  tRNA-Gly  86.11 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  86.11 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  86.11 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  90.74 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  90.74 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  90.74 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  90.74 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  91.11 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  91.11 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  91.11 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0016  tRNA-Gly  86.3 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.867595  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  91.11 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  91.11 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  91.11 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  91.11 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  91.11 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  91.11 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  91.11 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.58 
 
 
72 bp  56  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.850399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0045  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.356708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0063  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0028  tRNA-Gly  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.433481  normal  0.466553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0044  tRNA-Gly  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0024  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.664304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0025  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.89126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0028  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.500637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0066  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  90.38 
 
 
76 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0031  tRNA-Gly  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000029648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0046  tRNA-Gly  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.098729  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0028  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30863e-30 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0026  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0048  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  90.38 
 
 
76 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0034  tRNA-Gly  87.27 
 
 
75 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.558867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>