299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_R0031 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377899  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0046  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000231748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0048  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000268025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0050  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000555856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0009  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0063  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0026  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0024  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.664304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0025  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.89126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0028  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.500637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0066  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0028  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30863e-30 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0020  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0048  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0045  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.356708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0036  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0003  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100529 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0021  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0038  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.657012 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0005  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0001  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0019  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0036  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0039  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0041  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0030  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0007  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0006  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0030  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0009  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0035  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.724762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0921  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0021  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0023  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000214158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1650  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0016  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.867595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0006  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0241  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0038  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495704  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0010  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.695097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0011  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.770603  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0007  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264887  normal  0.61678 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0006  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000670589  normal  0.608185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0027  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133114  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0050  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00080  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000419569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00081  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000257411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0707  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0600854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0706  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0583224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0049  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4723  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.032e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0072  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000137146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t21  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t23  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t38  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0098  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000512871  hitchhiker  0.000011037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5111  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000015095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5039  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000010276  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0049  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4725  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.64891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R61  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R63  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4724  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.56815e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4671  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.05705e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5110  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5109  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0100  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000550184  hitchhiker  0.000011037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2055  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000108601  hitchhiker  0.000600208 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0099  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000502602  hitchhiker  0.0000112339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0048  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000507488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0001  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0012  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000103528  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0013  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000958382  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0014  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000460398  unclonable  0.00000183303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0051  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000228053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0029  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432235  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0031  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.623556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0045  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.0236363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0033  tRNA-Gly  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.688616  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0048  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0352694  hitchhiker  0.000658137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0077  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707613  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0078  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67777  normal  0.517696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>