47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Gly-2 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.850399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0054  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0037  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000929008  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0013  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0041  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0014  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000685902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0052  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0070  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0009  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000199446  normal  0.87079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0017  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000137246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0012  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000602687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0017  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0030  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000364961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0029  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.707259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0049  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0016  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203763  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0039  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169853  normal  0.361721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0043  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.607028  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA4  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0009  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0027  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3265  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3262  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3264  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0072  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0211705  normal  0.918041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3268  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000779558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0066  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000558399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0001  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0046  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.100607 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0048  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.395068  normal  0.100997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10770  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.029864  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>