73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0007 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0053  tRNA-Arg  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0017  tRNA-Arg  94.37 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0045  tRNA-Arg  92.54 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0034  tRNA-Arg  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.245593  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0012  tRNA-Arg  90 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0040  tRNA-Arg  86.96 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.913474  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0036  tRNA-Arg  93.18 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0930227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  92.11 
 
 
77 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000399427  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0014  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.20827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0506  tRNA-Val  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000210489  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  84.62 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1639  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.42917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4313  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.452504  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0219771  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0040  tRNA-Arg  87.5 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422727  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.261582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.855611  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0055  tRNA-Lys  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0045  tRNA-Arg  86.54 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.249789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0013  tRNA-Ala  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  89.74 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0041  tRNA-Arg  96.3 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0020  tRNA-Arg  96.3 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  89.74 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  86 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0928705  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  89.47 
 
 
79 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.334126  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0015  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2337  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  86 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0006  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0024  tRNA-Thr  100 
 
 
87 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397308  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0089  tRNA-Met  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0047  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00104453  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0015  tRNA-Thr  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.728322 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t28  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00553627  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0833672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.670239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  86 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0552  tRNA-Pro  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.775788  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  100 
 
 
1485 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1025  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0262205  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309103  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0620243  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309176  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1546  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0019  tRNA-Met  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0035  tRNA-Met  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.906537  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0043  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0089  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619101  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0027  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  86 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0036  tRNA-Met  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.784357  normal  0.0160013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0053  tRNA-Met  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307129  normal  0.0211178 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna46  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>