61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_R0026 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335207  hitchhiker  0.00751265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0033  tRNA-Arg  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0033  tRNA-Arg  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335539  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  91.3 
 
 
74 bp  89.7  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA31  tRNA-Arg  97.73 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216391  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0008  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0009  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122464  normal  0.0281964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0008  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0006  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0022  tRNA-Arg  97.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00187223  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  91.07 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  89.29 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0011  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966891  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  85.92 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0006  tRNA-Arg  88.89 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0048  tRNA-Arg  86.57 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544929  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0055  tRNA-Arg  88.89 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0855859  hitchhiker  0.00187773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000165448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0030  tRNA-Arg  86.96 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1462  tRNA-Arg  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0005  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000297571  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0094  tRNA-Arg  93.18 
 
 
76 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0085  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000064682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0010  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0016  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000000601684  hitchhiker  0.000695383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0010  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0098  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0004  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0015  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000253898  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0002  tRNA-Arg  90.48 
 
 
79 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000443996  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0042  tRNA-Arg  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309146  tRNA-Arg  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.465362  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0049  tRNA-Arg  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163876  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0017  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0314744  normal  0.604641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0032  tRNA-Arg  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0047  tRNA-Arg  92.68 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070675  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0055  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.300592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0048  tRNA-Arg  83.82 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000768741  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0029  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323491  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0004  tRNA-Arg  90 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0200827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0045  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00143112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0052  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0053  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673095  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna24  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0027  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0953414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0013  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0697011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0020  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0801009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0013  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0022  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>