29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0002 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000443996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0004  tRNA-Arg  88.06 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0200827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0033  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335539  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0033  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA31  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0005  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000297571  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0098  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0010  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410032  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0015  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000253898  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0022  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00187223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0026  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335207  hitchhiker  0.00751265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0057  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0008  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0009  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122464  normal  0.0281964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0006  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0008  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0009  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000808777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0016  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000000601684  hitchhiker  0.000695383 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0094  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0044  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>