33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_R0044 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514927  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.49867  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  100 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000427256  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.462611  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04240  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0085  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000064682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000202832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0015  tRNA-Arg  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000253898  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.889676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0034  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna022  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000131099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0038  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0257046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.1136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0454906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0002  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000443996  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3097t  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00485  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14028  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.989e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0013  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000258053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464578  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0068  tRNA-OTHER  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>