287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_R0019 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230793  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464578  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0037  tRNA-Arg  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0099  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0056  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000119061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0003  tRNA-Arg  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0034  tRNA-His  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0038  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.427754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0048  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0045  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0038  tRNA-His  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000137357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0015  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0014  tRNA-His  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0346111  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1683  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.792102  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0011  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0053  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0223382  normal  0.521756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0054    86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  85.51 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0009  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0038  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0257046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0013  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.249758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0064  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294983  normal  0.0656653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0068  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  0.377618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0001  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336526  hitchhiker  0.00896286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0006  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0067  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.645419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0058  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0008  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0010  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0050  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000388549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t05  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0010  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0062  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0037  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678102  normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0006  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0288  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0018  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000528633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  84 
 
 		 80 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  84 
 
 		 80 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0001  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  84 
 
 		 80 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0001  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383152  normal  0.0513953 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0011  tRNA-His  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0001  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0041  tRNA-His  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0113138  normal  0.890079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0044  tRNA-His  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000342103  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0028  tRNA-His  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.252923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0011  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.223913  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4595  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.372122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0003  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00889349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0021  tRNA-His  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0303  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0001  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0005  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1416  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1468  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2040  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000158642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1761  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27060  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.14879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>