21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_04240 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_04240  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0013  tRNA-Arg  87.84 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0055  tRNA-Arg  95.12 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0049  tRNA-Arg  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0051  tRNA-Arg  85.33 
 
 
76 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0001  tRNA-Arg  92.68 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0044  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514927  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.49867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0032  tRNA-Arg  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0053  tRNA-Arg  82.86 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673095  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna24  tRNA-Arg  82.86 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.426142  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.292104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>