37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0091 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0019  tRNA-Thr  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0018  tRNA-Thr  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0730  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0054  tRNA-Thr  88.57 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0062  tRNA-Thr  88.57 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0011  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330038 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03660  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.018948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  87.14 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  87.14 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0012  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04020  tRNA-Thr  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.730789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0025  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000414519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0048  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00108032  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0049  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  84.85 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3789  tRNA-Arg  84.85 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0011  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.176514  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04240  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  83.1 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0032  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.688346  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1354  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0033  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.389622  normal  0.782985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1226  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.186423  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt24  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00250215  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0025  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000411074  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0012  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0026  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>