183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_R0024 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0042  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309146  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.465362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0033  tRNA-Arg  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0033  tRNA-Arg  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0022  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00187223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  97.73 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA31  tRNA-Arg  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  91.53 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0021  tRNA-Arg  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0015  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000253898  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0031  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0048271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0009  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122464  normal  0.0281964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0008  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0008  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0006  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0055  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t21  tRNA-Trp  92 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0098  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0031  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0016  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000000601684  hitchhiker  0.000695383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0043  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0476411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0036  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.868247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0010  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410032  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1212  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0026  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335207  hitchhiker  0.00751265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0048  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t45  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0053  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0001  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0013  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156686  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0564  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0085  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000064682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0005  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000297571  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0948  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.391467  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0018  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.46927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0001  tRNA-Thr  88.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.200882  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0049  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0001  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0045  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0094  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0057  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0042  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0049  tRNA-Met  83.56 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0050  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 94 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0004  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0200827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0034  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0013  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000258053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0002  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000443996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.426142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0018  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000291564  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1404  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000898104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0067  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.588797  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  90 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0011  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0044  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0169442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01507  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000147856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0044  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.462611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3045  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3046  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0395002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000227912  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1589  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00193926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1590  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000176536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00501497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0013  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010358  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000191779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0248505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00884611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00243187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0048  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000768741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0011  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>