124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0031 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0044  tRNA-Arg  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.462611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0031  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.250775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0021  tRNA-Arg  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.426142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0030  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000202832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0052  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0033  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.49867  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0014  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000764457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0038  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0586  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0051  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0040  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0948  tRNA-Arg  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.391467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0042  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0030  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0045  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.350958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0050  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0016  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000516971  normal  0.0942255 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt027  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0013  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0017  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0029  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0013  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.195236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.617808  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01507  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000147856  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0076  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00038438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3045  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3046  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0395002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000227912  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000021714  normal  0.246057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0038  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000220683  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0042  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1589  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00193926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1590  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000176536  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.381218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0062  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0063  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0602741  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0136864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0081  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0141805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00501497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0013  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010358  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000191779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0248505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00884611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00243187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0818  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0819  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00579174  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2651  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00638973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2652  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0016  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.228908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2945  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0156149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2946  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3011  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.437147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3012  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.244587  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1960  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1961  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121216  normal  0.785903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00103992  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00109449  normal  0.51543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000476466  normal  0.507447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.110227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0479524  normal  0.8526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292671  normal  0.864836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.893816  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476936  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0012  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0077  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0042  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0069  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14016  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0067  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0050  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385714  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0069  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>