298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0024 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0038  tRNA-Arg  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0257046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0040  tRNA-Arg  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt025  tRNA-Arg  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000274648  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0014  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.434333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0066  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.171209  normal  0.834586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0045  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0007  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0005  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0009  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000206186  hitchhiker  0.00000000390519 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0024  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0050  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0039275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0004  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0003  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0003  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000538631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0048  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0071188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0049  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00771179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0015  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna11  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163451  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0067  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000219464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 80 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 80 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 80 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0023  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.328599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2217  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000281617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000388984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0037  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0911  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0732179  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0729  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0099  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0010  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0044  tRNA-Arg  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709803  normal  0.0256075 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0050  tRNA-Arg  87.18 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4320  tRNA-Arg  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.438611  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0003  tRNA-Arg  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0053  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000144377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0075  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306891  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0050  tRNA-Arg  87.18 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.557723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0038  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000962108  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0026  tRNA-Arg  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0422227  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14043  tRNA-Arg  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0938748  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0004  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0201744  hitchhiker  0.000641347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0055  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000119585  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0056  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000106381  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna10  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0012  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.802134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA32  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0019  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.737932  normal  0.0155784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0021  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222164  normal  0.330692 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0062  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0005  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000374311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0001  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0026  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>