283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0911 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0911  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0732179  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0038  tRNA-Arg  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000962108  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0075  tRNA-Arg  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306891  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03370  tRNA-Arg  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0053  tRNA-Arg  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000144377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0007  tRNA-Arg  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0011  tRNA-Arg  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.223913  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0023  tRNA-Arg  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.328599  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0729  tRNA-Arg  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  94.64 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0046  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0040  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0006  tRNA-Arg  94 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0010  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.552541  hitchhiker  0.000550393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0024  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000219464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0059  tRNA-Arg  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0586  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00782572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0057  tRNA-Arg  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0970774  normal  0.768528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0058  tRNA-Arg  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0059  tRNA-Arg  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0038  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0257046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0009  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0055  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0057  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0005  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134244  hitchhiker  0.00821182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0007  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0007  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0054  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0057  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0006  tRNA-Arg  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652554  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0009  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0056  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0061  tRNA-Arg  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000884624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0041  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000324571  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1052  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.270122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0026  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0003  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.972856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0777  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0772068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>