119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0729 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0729  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.328599  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0911  tRNA-Arg  91.94 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0732179  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0007  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0038  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0257046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0024  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0055  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000119585  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0056  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000106381  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4320  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.438611  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0026  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0422227  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0044  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709803  normal  0.0256075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0003  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0007  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0040  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0060  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.864941  normal  0.898441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0009  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.702831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6004  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0012  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.670239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt025  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000274648  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000884624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0740  tRNA-Arg  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0029  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.320042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0030  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.324137  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0026  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1576  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1611  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1052  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.270122  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0037  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0038  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000962108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0053  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000144377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0075  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0586  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00782572  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03370  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000245079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3789  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0605047  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0409907  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0041  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000324571  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t32  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0011176  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.601001  normal  0.725234 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0001  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.696589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0090  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.296295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0065  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 65 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg03  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0030  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.238826  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0179  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0015  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_R0064  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.005  hitchhiker  0.000281231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0078  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877536  decreased coverage  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0079  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000089994  decreased coverage  0.0000000414359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0080  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000892211  decreased coverage  0.0000000440433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0040  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4267  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305369  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4268  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000271712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4269  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.7764e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4270  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.97355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0800  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000572817  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2167  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01392  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03499  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03500  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03501  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03503  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03504  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03506  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2240  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6039  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0894  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0896  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000379192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0052  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0055  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0056  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0057  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0058  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0026  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0020  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3177t  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0036  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4582  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0275955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>