81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Arg-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0023  tRNA-Arg  92.11 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.328599  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0729  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0012  tRNA-Arg  94.12 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.670239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0024  tRNA-Arg  92.16 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0038  tRNA-Arg  92.16 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0257046  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0911  tRNA-Arg  92 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0732179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0026  tRNA-Arg  84.62 
 
 
77 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0422227  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4320  tRNA-Arg  84.62 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.438611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0044  tRNA-Arg  84.62 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709803  normal  0.0256075 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0026  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0003  tRNA-Arg  84.62 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0063  tRNA-Arg  89.8 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257054  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309183  tRNA-Arg  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.609025  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309275  tRNA-Arg  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0006  tRNA-Arg  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.981742  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0043  tRNA-Arg  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309359  tRNA-Arg  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0032  tRNA-Arg  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1390  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0040  tRNA-Arg  87.5 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000753452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0007  tRNA-Arg  88.24 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  88.24 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt025  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000274648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  88.24 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0059  tRNA-Arg  88.1 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.673271  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  90.48 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0007  tRNA-Arg  88.1 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.818817  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  90.48 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  90.48 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  90.48 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  90.48 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  90.48 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  90.48 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  90.48 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0006  tRNA-Arg  88.1 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0483173  normal  0.730879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  90.48 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  90.48 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000219464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  90.48 
 
 
80 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  90.48 
 
 
80 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  90.48 
 
 
80 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0061  tRNA-Arg  88.1 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0740  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000281617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000388984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0052  tRNA-Arg  88.1 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483727  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>