296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_R0065 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_R0065  tRNA-Arg  100 
 
 		 65 bp  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  89.7  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0954  tRNA-Arg  97.78 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t16  tRNA-Arg  97.78 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4334  tRNA-Arg  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0054  tRNA-Arg  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0462421  normal  0.0117618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0001  tRNA-Arg  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125316 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0610  tRNA-Arg  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0978805  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0036  tRNA-Arg  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277119  normal  0.546011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0005  tRNA-Arg  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345809  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0035  tRNA-Arg  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6028  tRNA-Arg  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0235921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0078  tRNA-Arg  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.148799  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0003  tRNA-Arg  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.744258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0022  tRNA-Arg  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0003  tRNA-Arg  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0001  tRNA-Arg  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693599  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t01  tRNA-Arg  95.45 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t01  tRNA-Arg  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA1  tRNA-Arg  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R7  tRNA-Arg  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365989  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0340  tRNA-Arg  97.5 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0010  tRNA-Arg  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0005  tRNA-Arg  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.964403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03410  tRNA-Arg  97.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000139149  hitchhiker  1.96604e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0001  tRNA-Arg  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0001  tRNA-Arg  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0036  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0016  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0055    95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.594029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0060  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0003  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0018  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0070  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.644432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0023  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0021  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0012  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0073  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0035  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0068  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0022  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0009  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0038  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0003  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000103446  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00067  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000401991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0107  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.38441e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0089  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4157  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4161  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0048  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.593319  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4260  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000095495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4319  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000432818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4199  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.81521e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5230  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0008  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000368398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5087  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000056915  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0525  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000996192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4710  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.38627e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4142  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000739333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4211  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000122851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0042  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00513283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0124  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000592514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4322  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.17442e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0004  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.710859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0001  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.265637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0091  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0001  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.436716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0097  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000263693  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0022  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0187  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0007  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0120  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0536302  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5037  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0058  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.11838  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0050  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0005  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60330  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.665088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0001  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0004  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0005  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31059  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4582  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0031  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0079  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000089994  decreased coverage  0.0000000414359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0078  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877536  decreased coverage  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0048  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.696589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0064  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg03  tRNA-Arg  100 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0080  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000892211  decreased coverage  0.0000000440433 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t05  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0119  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.495298  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4320  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.438611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0013  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.825441  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0066  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0002  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.469319 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0422227  normal  0.1826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>