191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0037 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0007  tRNA-Arg  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03370  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0003  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0911  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0732179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0040  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0038  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000962108  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0017  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121819  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0053  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000144377  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0574  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0075  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306891  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0019  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0224429  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2016  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0030  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0031  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.501356  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0033  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0010  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.552541  hitchhiker  0.000550393 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0029  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0011  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.223913  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0058  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19370  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0038  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0257046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1046  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t083  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t085  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t087  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t089  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t026  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000584816  hitchhiker  0.00000103487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0113  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000084866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0119  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000131096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t024  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000647415  hitchhiker  0.000000189876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0038  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000238811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0039  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000255751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0041  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000126984  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0056  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000025331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0109  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00006448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0115  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000013002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0043  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000076274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0045  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000811404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0047  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0049  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0044  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000145436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna10  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107608  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0046  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000251633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0053  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000298412  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0048  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000258429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0050  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0046  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0047  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.349818  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0049  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t023  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000185233  hitchhiker  0.0000000311481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0042  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000133594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0044  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000151065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0046  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0048  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t022  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000204678  hitchhiker  0.0000000336806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0118  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000119067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0117  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000112266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0043  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0112  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456139  hitchhiker  0.0000639392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0107  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0041  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0453151  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t021  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000593467  hitchhiker  0.0000000311481 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0095  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000787124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0098  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000015782  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0099  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165314  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0100  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0101  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000012367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0027  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0028  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0029  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000030616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0030  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000300498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t019  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000120774  hitchhiker  0.0000000298076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0091  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00116714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0024  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0093  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000449843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0095  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000145401  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0039  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0446173  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0037  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0424751  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0104  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000547181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0106  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0107  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000203726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0108  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000272922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0109  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000932697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>