32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0948 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0948  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.391467  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0012  tRNA-Arg  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.189298  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0002  tRNA-Arg  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0002  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000973138  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0031  tRNA-Arg  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0004  tRNA-Arg  93.94 
 
 
79 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0200827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0009  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0020  tRNA-Arg  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342392  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t41  tRNA-Arg  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0465377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0021  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0008  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.894814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1960  tRNA-Arg  91.43 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0056  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0059  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0059  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0031  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.250775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0044  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.462611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0020  tRNA-Arg  84.48 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0801009 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0057  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0970774  normal  0.768528 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309146  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.465362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.51263  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0042  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0058  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>