11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_R0009 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0054  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0020  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0013  tRNA-Arg  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0934099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0060  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000474185  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0002  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0948  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.391467  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0051  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000011528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0024  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0016  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000757074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>