165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0031 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.250775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0031  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0046  tRNA-Arg  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.426142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0021  tRNA-Arg  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0013  tRNA-Arg  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.195236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0030  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0014  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000764457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0586  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177308  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0044  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.462611  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6039  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0051  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476936  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1291  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0077  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0929  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0069  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0017  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.034948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0080  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.833302  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0042  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0069  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14016  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0067  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2639  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1010  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1126  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0253785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1133  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0137  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0069  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0012  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.255284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0052  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt027  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0013  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0038  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11730  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827241  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t50  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294768  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t45  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA31  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.977486  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0043  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478862  hitchhiker  0.000308471 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0045  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R55  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000100399  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3506  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0042  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0004  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0027  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0953414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0043  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60210  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0026  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41340  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.383585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0016  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000516971  normal  0.0942255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0041  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0106412  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0040  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0063  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0013  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0050  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309146  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.465362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0039  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247045  normal  0.262143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0059  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413322 
 
 
-
 
NC_002950  PGt34  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000427256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.465736  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0124116  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000700916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0116  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000040989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0030  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000202832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0050  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0033  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.296295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0028  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000461136  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0007  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454934  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0023  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0490  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1999  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0773774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00552371  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100318  hitchhiker  0.00586866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0006  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574401  hitchhiker  0.000034907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0084  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0052  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479679 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0061  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.312236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.619754 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>