37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_R0012 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0948  tRNA-Arg  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.391467  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0051  tRNA-Arg  89.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0051  tRNA-Arg  89.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0020  tRNA-Arg  89.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0801009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0002  tRNA-Arg  89.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000973138  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0629  tRNA-Arg  89.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.189298  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0056  tRNA-Arg  97.44 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  87.69 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4575  tRNA-Arg  88.33 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0053  tRNA-Arg  88.33 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686507  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0030  tRNA-Arg  95 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0160344  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1960  tRNA-Arg  91.11 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0008  tRNA-Arg  91.11 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.894814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t41  tRNA-Arg  91.11 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0465377  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0037  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0828388  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0020  tRNA-Arg  90.91 
 
 
74 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00283312  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0020  tRNA-Arg  90.7 
 
 
74 bp  54  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342392  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0002  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000291564  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0200827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0044  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.462611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309176  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309279  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309215  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.266005  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309135  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309103  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0620243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0060  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000474185  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0040  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0012  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0037  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0031  tRNA-Arg  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0022  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>