59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0015 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0015  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0043  tRNA-Arg  95.77 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.473325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0017  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0801926 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0048  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0065  tRNA-Arg  93.24 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0045  tRNA-Arg  93.24 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0128095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0009  tRNA-Arg  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.184283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0047  tRNA-Arg  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0049  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198977  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0034  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00361303  normal  0.0286488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0069  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18410  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0950297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0048  tRNA-Arg  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0506396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0014  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0049  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.428212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0012  tRNA-Arg  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251285  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0022  tRNA-Arg  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00454117  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0032  tRNA-Arg  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0086  tRNA-Arg  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0091  tRNA-Arg  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0020  tRNA-Arg  88.41 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0002  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0016  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0798603  decreased coverage  0.00114239 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0042  tRNA-Arg  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110634  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 89 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24430  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32790  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0022  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.99617  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0042  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0415114  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0010  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0039  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.780721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0026  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0263257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0043  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0069  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.092097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14018  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0039  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0048  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358997  normal  0.0149613 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0043  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924826  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0046  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.455447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0043  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0013  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.195236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0018  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0050  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.679099  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27110  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0054  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0046  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.979271  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0011  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0234667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0043  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0045  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0015  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0076  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0052  tRNA-Arg  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.108148  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30640  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.587874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0017  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0047  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.23821 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>